Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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