Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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