Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmeff2Q9QYM9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmeff2Q9QYM9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms