Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42ep4Q9JM96 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdc42ep4Q9JM96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42ep4Q9JM96 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42ep4Q9JM96 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42ep4Q9JM96 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms