Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgn5Q9JL35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmgn5Q9JL35 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmgn5Q9JL35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmgn5Q9JL35 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmgn5Q9JL35 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms