Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
V1ra8Q9EQ48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1ra8Q9EQ48 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1ra8Q9EQ48 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms