Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tube1Q9D6T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tube1Q9D6T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tube1Q9D6T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tube1Q9D6T1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tube1Q9D6T1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tube1Q9D6T1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms