Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox2aQ9D4Y3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox2aQ9D4Y3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms