Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J3

Dcbld1, Discoidin, CUB and LCCL domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcbld1Q9D4J3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dcbld1Q9D4J3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dcbld1Q9D4J3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dcbld1Q9D4J3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dcbld1Q9D4J3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dcbld1Q9D4J3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dcbld1Q9D4J3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcbld1Q9D4J3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcbld1Q9D4J3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcbld1Q9D4J3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dcbld1Q9D4J3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.7 ms