Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4G9

Rmi1, RecQ-mediated genome instability protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi1Q9D4G9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rmi1Q9D4G9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rmi1Q9D4G9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rmi1Q9D4G9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rmi1Q9D4G9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rmi1Q9D4G9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms