Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SarnpQ9D1J3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SarnpQ9D1J3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarnpQ9D1J3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms