Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms