Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp11Q9CZJ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp11Q9CZJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp11Q9CZJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp11Q9CZJ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms