Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gins4Q99LZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gins4Q99LZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins4Q99LZ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins4Q99LZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms