Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcf2Q99LE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcf2Q99LE6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf2Q99LE6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf2Q99LE6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms