Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4aQ8VEJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps4aQ8VEJ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps4aQ8VEJ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms