Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa1Q8VEE4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa1Q8VEE4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpa1Q8VEE4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa1Q8VEE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa1Q8VEE4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa1Q8VEE4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.9 ms