Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc115Q8VE99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc115Q8VE99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc115Q8VE99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms