Protein–RNA interactions for Protein: Q8C898

C130026I21Rik, RIKEN cDNA C130026I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C130026I21RikQ8C898 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C130026I21RikQ8C898 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C130026I21RikQ8C898 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C130026I21RikQ8C898 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C130026I21RikQ8C898 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C130026I21RikQ8C898 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C130026I21RikQ8C898 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C130026I21RikQ8C898 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C130026I21RikQ8C898 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C130026I21RikQ8C898 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms