Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TiparpQ8C1B2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TiparpQ8C1B2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TiparpQ8C1B2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms