Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
TiparpQ8C1B2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TiparpQ8C1B2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TiparpQ8C1B2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TiparpQ8C1B2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TiparpQ8C1B2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TiparpQ8C1B2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TiparpQ8C1B2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TiparpQ8C1B2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TiparpQ8C1B2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TiparpQ8C1B2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TiparpQ8C1B2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TiparpQ8C1B2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TiparpQ8C1B2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TiparpQ8C1B2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TiparpQ8C1B2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TiparpQ8C1B2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TiparpQ8C1B2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TiparpQ8C1B2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TiparpQ8C1B2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TiparpQ8C1B2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TiparpQ8C1B2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TiparpQ8C1B2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TiparpQ8C1B2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TiparpQ8C1B2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TiparpQ8C1B2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TiparpQ8C1B2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TiparpQ8C1B2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TiparpQ8C1B2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TiparpQ8C1B2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TiparpQ8C1B2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TiparpQ8C1B2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TiparpQ8C1B2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TiparpQ8C1B2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TiparpQ8C1B2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TiparpQ8C1B2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TiparpQ8C1B2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TiparpQ8C1B2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TiparpQ8C1B2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TiparpQ8C1B2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TiparpQ8C1B2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TiparpQ8C1B2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TiparpQ8C1B2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TiparpQ8C1B2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TiparpQ8C1B2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TiparpQ8C1B2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TiparpQ8C1B2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TiparpQ8C1B2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TiparpQ8C1B2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TiparpQ8C1B2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TiparpQ8C1B2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TiparpQ8C1B2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TiparpQ8C1B2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TiparpQ8C1B2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TiparpQ8C1B2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TiparpQ8C1B2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TiparpQ8C1B2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TiparpQ8C1B2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TiparpQ8C1B2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TiparpQ8C1B2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TiparpQ8C1B2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TiparpQ8C1B2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TiparpQ8C1B2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TiparpQ8C1B2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TiparpQ8C1B2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TiparpQ8C1B2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TiparpQ8C1B2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TiparpQ8C1B2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TiparpQ8C1B2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TiparpQ8C1B2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TiparpQ8C1B2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TiparpQ8C1B2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TiparpQ8C1B2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TiparpQ8C1B2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TiparpQ8C1B2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TiparpQ8C1B2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TiparpQ8C1B2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TiparpQ8C1B2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TiparpQ8C1B2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TiparpQ8C1B2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TiparpQ8C1B2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TiparpQ8C1B2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TiparpQ8C1B2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TiparpQ8C1B2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TiparpQ8C1B2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TiparpQ8C1B2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TiparpQ8C1B2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TiparpQ8C1B2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TiparpQ8C1B2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TiparpQ8C1B2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TiparpQ8C1B2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TiparpQ8C1B2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TiparpQ8C1B2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TiparpQ8C1B2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TiparpQ8C1B2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TiparpQ8C1B2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TiparpQ8C1B2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TiparpQ8C1B2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TiparpQ8C1B2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TiparpQ8C1B2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms