Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl29Q80T74 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl29Q80T74 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl29Q80T74 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhl29Q80T74 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms