Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igsf5Q7TSN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Igsf5Q7TSN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Igsf5Q7TSN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms