Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnih3Q6ZWS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih3Q6ZWS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih3Q6ZWS4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cnih3Q6ZWS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms