Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms