Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScxQ64124 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScxQ64124 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScxQ64124 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScxQ64124 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScxQ64124 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScxQ64124 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScxQ64124 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScxQ64124 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScxQ64124 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScxQ64124 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScxQ64124 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScxQ64124 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms