Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp4Q61107 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp4Q61107 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gbp4Q61107 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp4Q61107 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp4Q61107 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms