Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca4bQ3UW98 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca4bQ3UW98 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca4bQ3UW98 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca4bQ3UW98 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms