Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnga4Q3UW12 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnga4Q3UW12 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga4Q3UW12 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga4Q3UW12 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms