Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA38

Tmem120b, Transmembrane protein 120B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem120bQ3TA38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem120bQ3TA38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem120bQ3TA38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem120bQ3TA38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem120bQ3TA38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms