Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MitfQ08874 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MitfQ08874 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MitfQ08874 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MitfQ08874 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MitfQ08874 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MitfQ08874 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MitfQ08874 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MitfQ08874 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MitfQ08874 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MitfQ08874 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MitfQ08874 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MitfQ08874 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MitfQ08874 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MitfQ08874 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MitfQ08874 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MitfQ08874 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MitfQ08874 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MitfQ08874 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MitfQ08874 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MitfQ08874 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MitfQ08874 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MitfQ08874 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MitfQ08874 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MitfQ08874 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MitfQ08874 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms