Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdx4Q07424 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdx4Q07424 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdx4Q07424 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms