Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah2Q06986 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah2Q06986 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Siah2Q06986 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah2Q06986 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms