Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnd1Q03719 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnd1Q03719 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnd1Q03719 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnd1Q03719 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms