Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx2P97474 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pitx2P97474 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pitx2P97474 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx2P97474 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms