Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bop1P97452 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bop1P97452 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bop1P97452 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bop1P97452 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bop1P97452 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bop1P97452 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bop1P97452 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bop1P97452 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bop1P97452 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bop1P97452 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bop1P97452 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bop1P97452 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bop1P97452 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bop1P97452 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms