Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irx3P81067 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx3P81067 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx3P81067 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx3P81067 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx3P81067 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx3P81067 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx3P81067 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx3P81067 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx3P81067 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx3P81067 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx3P81067 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx3P81067 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx3P81067 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx3P81067 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx3P81067 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx3P81067 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx3P81067 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms