Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad1P70340 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad1P70340 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad1P70340 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad1P70340 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad1P70340 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad1P70340 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad1P70340 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad1P70340 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad1P70340 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad1P70340 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad1P70340 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad1P70340 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad1P70340 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad1P70340 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad1P70340 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad1P70340 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad1P70340 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad1P70340 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms