Protein–RNA interactions for Protein: P53146

USE1, Protein transport protein USE1, yeastyeast

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USE1P53146 SEC24YIL109C 2781 nt7.61□□□□□ -1.19
USE1P53146 MAS1YLR163C 1389 nt7.6□□□□□ -1.19
USE1P53146 RAD51YER095W 1203 nt7.6□□□□□ -1.19
USE1P53146 PRB1YEL060C 1908 nt7.6□□□□□ -1.19
USE1P53146 RMD8YFR048W 1989 nt7.59□□□□□ -1.19
USE1P53146 DCR2YLR361C 1737 nt7.59□□□□□ -1.19
USE1P53146 RPL12BYDR418W 498 nt7.59□□□□□ -1.19
USE1P53146 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.59□□□□□ -1.19
USE1P53146 ATO2YNR002C 849 nt7.59□□□□□ -1.19
USE1P53146 TIM50YPL063W 1431 nt7.59□□□□□ -1.19
USE1P53146 HNM1YGL077C 1692 nt7.58□□□□□ -1.2
USE1P53146 ADH7YCR105W 1086 nt7.58□□□□□ -1.2
USE1P53146 YJL043WYJL043W 774 nt7.58□□□□□ -1.2
USE1P53146 ERV25YML012W 636 nt7.57□□□□□ -1.2
USE1P53146 CTF3YLR381W 2202 nt7.57□□□□□ -1.2
USE1P53146 TCB1YOR086C 3561 nt7.56□□□□□ -1.2
USE1P53146 BNA3YJL060W 1335 nt7.56□□□□□ -1.2
USE1P53146 CDC23YHR166C 1881 nt7.56□□□□□ -1.2
USE1P53146 PRE10YOR362C 867 nt7.56□□□□□ -1.2
USE1P53146 JHD1YER051W 1479 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 TOD6YBL054W 1578 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 AFG2YLR397C 2343 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 PAU15YIR041W 375 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 LSP1YPL004C 1026 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 MNN9YPL050C 1188 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 YBR232CYBR232C 360 nt7.55□□□□□ -1.2
USE1P53146 YPT31YER031C 672 nt7.54□□□□□ -1.2
USE1P53146 YGR210CYGR210C 1236 nt7.54□□□□□ -1.2
USE1P53146 RRT14YIL127C 621 nt7.54□□□□□ -1.2
USE1P53146 MCM5YLR274W 2328 nt7.53□□□□□ -1.2
USE1P53146 ARG7YMR062C 1326 nt7.53□□□□□ -1.2
USE1P53146 SER2YGR208W 930 nt7.53□□□□□ -1.2
USE1P53146 FLC2YAL053W 2352 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 TPI1YDR050C 747 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.52□□□□□ -1.21
USE1P53146 GTS1YGL181W 1191 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 YHR033WYHR033W 1272 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 PET10YKR046C 852 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 SNF7YLR025W 723 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 BXI1YNL305C 894 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 YPL108WYPL108W 507 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 CKI1YLR133W 1749 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 MAS2YHR024C 1449 nt7.51□□□□□ -1.21
USE1P53146 YDR215CYDR215C 414 nt7.5□□□□□ -1.21
USE1P53146 YCR025CYCR025C 411 nt7.49□□□□□ -1.21
USE1P53146 NAP1YKR048C 1254 nt7.49□□□□□ -1.21
USE1P53146 CPR2YHR057C 618 nt7.48□□□□□ -1.21
USE1P53146 HTS1YPR033C 1641 nt7.48□□□□□ -1.21
USE1P53146 ENB1YOL158C 1821 nt7.48□□□□□ -1.21
USE1P53146 PET18YCR020C 648 nt7.47□□□□□ -1.21
USE1P53146 CAR2YLR438W 1275 nt7.47□□□□□ -1.21
USE1P53146 MSS51YLR203C 1311 nt7.47□□□□□ -1.21
USE1P53146 RPS6AYPL090C 711 nt7.46□□□□□ -1.22
USE1P53146 RPS6BYBR181C 711 nt7.46□□□□□ -1.22
USE1P53146 YPC1YBR183W 951 nt7.46□□□□□ -1.22
USE1P53146 CAN1YEL063C 1773 nt7.46□□□□□ -1.22
USE1P53146 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.45□□□□□ -1.22
USE1P53146 YIL108WYIL108W 2091 nt7.45□□□□□ -1.22
USE1P53146 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.44□□□□□ -1.22
USE1P53146 RFS1YBR052C 633 nt7.44□□□□□ -1.22
USE1P53146 YGL260WYGL260W 231 nt7.43□□□□□ -1.22
USE1P53146 PMU1YKL128C 888 nt7.43□□□□□ -1.22
USE1P53146 DAL80YKR034W 810 nt7.43□□□□□ -1.22
USE1P53146 RTC2YBR147W 891 nt7.43□□□□□ -1.22
USE1P53146 NDE1YMR145C 1683 nt7.41□□□□□ -1.22
USE1P53146 YER156CYER156C 1017 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 YKL147CYKL147C 618 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 PRY2YKR013W 990 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 YNL040WYNL040W 1371 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 STE3YKL178C 1413 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 ATP2YJR121W 1536 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 FCY2YER056C 1602 nt7.4□□□□□ -1.22
USE1P53146 YBL111CYBL111C 2004 nt7.4□□□□□ -1.23
USE1P53146 YAH1YPL252C 519 nt7.39□□□□□ -1.23
USE1P53146 FCY1YPR062W 477 nt7.39□□□□□ -1.23
USE1P53146 LOT6YLR011W 576 nt7.38□□□□□ -1.23
USE1P53146 LIP5YOR196C 1245 nt7.38□□□□□ -1.23
USE1P53146 PPS1YBR276C 2424 nt7.37□□□□□ -1.23
USE1P53146 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.37□□□□□ -1.23
USE1P53146 EXG2YDR261C 1689 nt7.37□□□□□ -1.23
USE1P53146 YNL295WYNL295W 1575 nt7.37□□□□□ -1.23
USE1P53146 AFG3YER017C 2286 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 BAP3YDR046C 1815 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 HRA1HRA1 564 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 APT1YML022W 564 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 YMR206WYMR206W 942 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 FRA1YLL029W 2250 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 NUP84YDL116W 2181 nt7.36□□□□□ -1.23
USE1P53146 NUP57YGR119C 1626 nt7.35□□□□□ -1.23
USE1P53146 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.35□□□□□ -1.23
USE1P53146 YJL160CYJL160C 864 nt7.35□□□□□ -1.23
USE1P53146 YPR084WYPR084W 1371 nt7.34□□□□□ -1.23
USE1P53146 YDR327WYDR327W 327 nt7.34□□□□□ -1.23
USE1P53146 OPI1YHL020C 1215 nt7.34□□□□□ -1.23
USE1P53146 YOR012WYOR012W 414 nt7.34□□□□□ -1.23
USE1P53146 BDS1YOL164W 1941 nt7.33□□□□□ -1.24
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