Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nkx1-2P42580 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx1-2P42580 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx1-2P42580 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms