Protein–RNA interactions for Protein: P40438

VTH1, VPS10 homolog 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VTH1P40438 INP54YOL065C 1155 nt11.39□□□□□ -0.59
VTH1P40438 STE3YKL178C 1413 nt11.39□□□□□ -0.59
VTH1P40438 SNP1YIL061C 903 nt11.38□□□□□ -0.59
VTH1P40438 RRP43YCR035C 1185 nt11.36□□□□□ -0.59
VTH1P40438 DPM1YPR183W 804 nt11.36□□□□□ -0.59
VTH1P40438 MTO1YGL236C 2010 nt11.35□□□□□ -0.59
VTH1P40438 INH1YDL181W 258 nt11.35□□□□□ -0.59
VTH1P40438 YMR074CYMR074C 438 nt11.35□□□□□ -0.59
VTH1P40438 ERG10YPL028W 1197 nt11.35□□□□□ -0.59
VTH1P40438 SUN4YNL066W 1263 nt11.35□□□□□ -0.59
VTH1P40438 HXT10YFL011W 1641 nt11.34□□□□□ -0.59
VTH1P40438 NAF1YNL124W 1479 nt11.34□□□□□ -0.59
VTH1P40438 YML122CYML122C 381 nt11.34□□□□□ -0.59
VTH1P40438 SKP1YDR328C 585 nt11.33□□□□□ -0.6
VTH1P40438 PRY2YKR013W 990 nt11.33□□□□□ -0.6
VTH1P40438 MNN9YPL050C 1188 nt11.32□□□□□ -0.6
VTH1P40438 UME6YDR207C 2511 nt11.32□□□□□ -0.6
VTH1P40438 DST1YGL043W 930 nt11.31□□□□□ -0.6
VTH1P40438 WSC3YOL105C 1671 nt11.29□□□□□ -0.6
VTH1P40438 HRB1YNL004W 1365 nt11.29□□□□□ -0.6
VTH1P40438 PPZ2YDR436W 2133 nt11.29□□□□□ -0.6
VTH1P40438 HAM1YJR069C 594 nt11.29□□□□□ -0.6
VTH1P40438 OPI1YHL020C 1215 nt11.28□□□□□ -0.6
VTH1P40438 YLR162WYLR162W 357 nt11.28□□□□□ -0.6
VTH1P40438 ERV25YML012W 636 nt11.27□□□□□ -0.61
VTH1P40438 HIS3YOR202W 663 nt11.27□□□□□ -0.61
VTH1P40438 DML1YMR211W 1428 nt11.27□□□□□ -0.61
VTH1P40438 YMR209CYMR209C 1374 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 MTC6YHR151C 1581 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 OPI7YDR360W 435 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 PIL1YGR086C 1020 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 MDH1YKL085W 1005 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 DSC3YOR223W 879 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 TIF3YPR163C 1311 nt11.26□□□□□ -0.61
VTH1P40438 CPR2YHR057C 618 nt11.25□□□□□ -0.61
VTH1P40438 NFS1YCL017C 1494 nt11.25□□□□□ -0.61
VTH1P40438 NDE2YDL085W 1638 nt11.25□□□□□ -0.61
VTH1P40438 TRP2YER090W 1524 nt11.25□□□□□ -0.61
VTH1P40438 IMD1YAR073W 1212 nt11.25□□□□□ -0.61
VTH1P40438 YPL136WYPL136W 369 nt11.25□□□□□ -0.61
VTH1P40438 MRPL35YDR322W 1104 nt11.23□□□□□ -0.61
VTH1P40438 GLY1YEL046C 1164 nt11.23□□□□□ -0.61
VTH1P40438 YGR137WYGR137W 375 nt11.23□□□□□ -0.61
VTH1P40438 SML1YML058W 315 nt11.23□□□□□ -0.61
VTH1P40438 THI6YPL214C 1623 nt11.22□□□□□ -0.61
VTH1P40438 WSC4YHL028W 1818 nt11.22□□□□□ -0.61
VTH1P40438 DCR2YLR361C 1737 nt11.22□□□□□ -0.61
VTH1P40438 YJL225CYJL225C 5277 nt11.2□□□□□ -0.62
VTH1P40438 YPT10YBR264C 600 nt11.2□□□□□ -0.62
VTH1P40438 ABP1YCR088W 1779 nt11.2□□□□□ -0.62
VTH1P40438 SCS22YBL091C-A 528 nt11.19□□□□□ -0.62
VTH1P40438 AOS1YPR180W 1044 nt11.19□□□□□ -0.62
VTH1P40438 YPC1YBR183W 951 nt11.19□□□□□ -0.62
VTH1P40438 DMA2YNL116W 1569 nt11.19□□□□□ -0.62
VTH1P40438 LIA1YJR070C 978 nt11.19□□□□□ -0.62
VTH1P40438 YPR130CYPR130C 408 nt11.19□□□□□ -0.62
VTH1P40438 FIT1YDR534C 1587 nt11.18□□□□□ -0.62
VTH1P40438 TDA4YJR116W 840 nt11.18□□□□□ -0.62
VTH1P40438 MRP7YNL005C 1116 nt11.18□□□□□ -0.62
VTH1P40438 MRPL19YNL185C 477 nt11.18□□□□□ -0.62
VTH1P40438 GPD1YDL022W 1176 nt11.15□□□□□ -0.62
VTH1P40438 YLR030WYLR030W 792 nt11.15□□□□□ -0.62
VTH1P40438 ELP6YMR312W 822 nt11.15□□□□□ -0.62
VTH1P40438 FCY22YER060W-A 1593 nt11.15□□□□□ -0.62
VTH1P40438 SSC1YJR045C 1965 nt11.15□□□□□ -0.63
VTH1P40438 GET2YER083C 858 nt11.14□□□□□ -0.63
VTH1P40438 TGL5YOR081C 2250 nt11.13□□□□□ -0.63
VTH1P40438 CIA1YDR267C 993 nt11.11□□□□□ -0.63
VTH1P40438 YCL049CYCL049C 939 nt11.11□□□□□ -0.63
VTH1P40438 YKL153WYKL153W 510 nt11.1□□□□□ -0.63
VTH1P40438 YLR072WYLR072W 2082 nt11.1□□□□□ -0.63
VTH1P40438 QRI5YLR204W 336 nt11.09□□□□□ -0.63
VTH1P40438 SRM1YGL097W 1449 nt11.09□□□□□ -0.63
VTH1P40438 INM1YHR046C 888 nt11.09□□□□□ -0.63
VTH1P40438 MRN1YPL184C 1839 nt11.09□□□□□ -0.63
VTH1P40438 YDR387CYDR387C 1668 nt11.06□□□□□ -0.64
VTH1P40438 FET5YFL041W 1869 nt11.06□□□□□ -0.64
VTH1P40438 HXT11YOL156W 1704 nt11.06□□□□□ -0.64
VTH1P40438 YJL163CYJL163C 1668 nt11.05□□□□□ -0.64
VTH1P40438 YHR033WYHR033W 1272 nt11.04□□□□□ -0.64
VTH1P40438 ERR3YMR323W 1314 nt11.03□□□□□ -0.64
VTH1P40438 PAM17YKR065C 594 nt11.03□□□□□ -0.64
VTH1P40438 LEA1YPL213W 717 nt11.03□□□□□ -0.64
VTH1P40438 ILV6YCL009C 930 nt11.03□□□□□ -0.64
VTH1P40438 PAB1YER165W 1734 nt11.02□□□□□ -0.64
VTH1P40438 DRE2YKR071C 1047 nt11.02□□□□□ -0.65
VTH1P40438 CCW12YLR110C 402 nt11.02□□□□□ -0.65
VTH1P40438 RIM8YGL045W 1629 nt11.01□□□□□ -0.65
VTH1P40438 DAL80YKR034W 810 nt11.01□□□□□ -0.65
VTH1P40438 VPS65YLR322W 315 nt11.01□□□□□ -0.65
VTH1P40438 YOL046CYOL046C 675 nt11.01□□□□□ -0.65
VTH1P40438 MET13YGL125W 1803 nt11.01□□□□□ -0.65
VTH1P40438 IMG1YCR046C 510 nt11□□□□□ -0.65
VTH1P40438 TUB1YML085C 1344 nt10.99□□□□□ -0.65
VTH1P40438 PSD1YNL169C 1503 nt10.99□□□□□ -0.65
VTH1P40438 LCL3YGL085W 825 nt10.99□□□□□ -0.65
VTH1P40438 HOC1YJR075W 1191 nt10.99□□□□□ -0.65
VTH1P40438 CDA1YLR307W 906 nt10.98□□□□□ -0.65
VTH1P40438 TPO1YLL028W 1761 nt10.97□□□□□ -0.65
VTH1P40438 AGX1YFL030W 1158 nt10.97□□□□□ -0.65
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