Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjc1P28229 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjc1P28229 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjc1P28229 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms