Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9P06683 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9P06683 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9P06683 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9P06683 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9P06683 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9P06683 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9P06683 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9P06683 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9P06683 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P06683 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P06683 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9P06683 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9P06683 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P06683 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P06683 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P06683 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9P06683 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9P06683 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P06683 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P06683 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9P06683 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9P06683 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P06683 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P06683 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P06683 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P06683 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9P06683 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9P06683 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P06683 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P06683 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P06683 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P06683 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P06683 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9P06683 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9P06683 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9P06683 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P06683 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P06683 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P06683 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9P06683 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9P06683 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P06683 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P06683 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9P06683 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P06683 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9P06683 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9P06683 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9P06683 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9P06683 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9P06683 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9P06683 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9P06683 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9P06683 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9P06683 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9P06683 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9P06683 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9P06683 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9P06683 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9P06683 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9P06683 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms