Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
C9P06683 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9P06683 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
C9P06683 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C9P06683 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
C9P06683 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C9P06683 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
C9P06683 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C9P06683 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C9P06683 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C9P06683 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C9P06683 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
C9P06683 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9P06683 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9P06683 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C9P06683 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C9P06683 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
C9P06683 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C9P06683 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9P06683 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9P06683 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9P06683 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9P06683 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9P06683 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9P06683 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9P06683 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9P06683 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9P06683 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9P06683 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9P06683 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9P06683 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9P06683 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9P06683 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9P06683 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9P06683 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C9P06683 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9P06683 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9P06683 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9P06683 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9P06683 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C9P06683 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9P06683 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9P06683 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C9P06683 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9P06683 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C9P06683 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9P06683 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C9P06683 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9P06683 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9P06683 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9P06683 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C9P06683 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9P06683 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9P06683 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9P06683 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C9P06683 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9P06683 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9P06683 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9P06683 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9P06683 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C9P06683 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9P06683 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9P06683 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9P06683 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9P06683 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C9P06683 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9P06683 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9P06683 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C9P06683 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C9P06683 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9P06683 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9P06683 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9P06683 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C9P06683 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9P06683 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9P06683 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9P06683 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9P06683 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9P06683 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9P06683 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C9P06683 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9P06683 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C9P06683 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9P06683 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C9P06683 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C9P06683 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9P06683 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9P06683 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C9P06683 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9P06683 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C9P06683 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9P06683 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9P06683 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9P06683 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9P06683 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9P06683 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9P06683 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9P06683 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9P06683 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C9P06683 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms