Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap1O55125 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap1O55125 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap1O55125 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms