Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdkO55028 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdkO55028 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BckdkO55028 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BckdkO55028 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BckdkO55028 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BckdkO55028 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BckdkO55028 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BckdkO55028 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BckdkO55028 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BckdkO55028 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BckdkO55028 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BckdkO55028 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BckdkO55028 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BckdkO55028 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BckdkO55028 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BckdkO55028 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BckdkO55028 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BckdkO55028 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BckdkO55028 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BckdkO55028 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BckdkO55028 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BckdkO55028 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BckdkO55028 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BckdkO55028 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BckdkO55028 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BckdkO55028 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BckdkO55028 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BckdkO55028 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BckdkO55028 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BckdkO55028 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BckdkO55028 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BckdkO55028 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BckdkO55028 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BckdkO55028 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BckdkO55028 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms