Protein–RNA interactions for Protein: I6L9G2

Gm42641, 6620401K05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42641I6L9G2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm42641I6L9G2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm42641I6L9G2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm42641I6L9G2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm42641I6L9G2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm42641I6L9G2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm42641I6L9G2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm42641I6L9G2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm42641I6L9G2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms