Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp17lcG5E8I7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17lcG5E8I7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17lcG5E8I7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Usp17lcG5E8I7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lcG5E8I7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17lcG5E8I7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17lcG5E8I7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17lcG5E8I7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17lcG5E8I7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lcG5E8I7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lcG5E8I7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
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