Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba1B2RUJ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apba1B2RUJ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apba1B2RUJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apba1B2RUJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms