Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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